Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrfQ9JM73 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SrfQ9JM73 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SrfQ9JM73 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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