Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cul3Q9JLV5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cul3Q9JLV5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms