Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod4Q9JLH8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms