Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SacsQ9JLC8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SacsQ9JLC8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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