Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gde1Q9JL56 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gde1Q9JL56 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms