Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb3Q9JKS4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ldb3Q9JKS4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms