Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cyp39a1Q9JKJ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms