Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms