Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alyref2Q9JJW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alyref2Q9JJW6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms