Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Bco1Q9JJS6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Bco1Q9JJS6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Bco1Q9JJS6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Bco1Q9JJS6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Bco1Q9JJS6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Bco1Q9JJS6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bco1Q9JJS6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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