Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Riox1Q9JJF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms