Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ssna1Q9JJ94 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssna1Q9JJ94 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssna1Q9JJ94 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssna1Q9JJ94 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssna1Q9JJ94 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssna1Q9JJ94 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssna1Q9JJ94 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssna1Q9JJ94 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssna1Q9JJ94 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssna1Q9JJ94 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ssna1Q9JJ94 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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