Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms