Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms