Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MkksQ9JI70 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MkksQ9JI70 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms