Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LratQ9JI60 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms