Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pus3Q9JI38 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pus3Q9JI38 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms