Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtaQ9JHK4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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