Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcirg1Q9JHF5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms