Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cmtm7Q9ESD6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cmtm7Q9ESD6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms