Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp29Q9ES63 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms