Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms