Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trhr2Q9ERT2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trhr2Q9ERT2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms