Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chrnb2Q9ERK7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 456.3 ms