Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlnrd1Q9ERE8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms