Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms