Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox9Q9EQM5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms