Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ndst3Q9EQH7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndst3Q9EQH7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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