Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Vmn1r44Q9EQ47 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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