Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r41Q9EQ44 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r41Q9EQ44 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms