Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pold3Q9EQ28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pold3Q9EQ28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms