Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SgshQ9EQ08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms