Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r53Q9EP93 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r53Q9EP93 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms