Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms