Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdf2Q9DCT5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdf2Q9DCT5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms