Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnft1Q9DCN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms