Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc97Q9DBT3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms