Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fundc1Q9DB70 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms