Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms