Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim23Q9DAL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms