Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc89Q9DA73 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc89Q9DA73 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms