Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms