Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntd1Q9D995 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntd1Q9D995 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntd1Q9D995 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntd1Q9D995 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntd1Q9D995 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntd1Q9D995 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntd1Q9D995 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms