Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chmp4bQ9D8B3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms