Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms