Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4cQ9D7F7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp4cQ9D7F7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms