Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn23Q9D7D7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn23Q9D7D7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn23Q9D7D7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn23Q9D7D7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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