Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfsf13Q9D777 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms