Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc3Q9D6Y1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc3Q9D6Y1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms