Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms